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快速DNA连接试剂盒 |
产品编号: D7003
产品包装: 500次
产品价格: 666.00元 |
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产品简介
产品简介:
快速DNA连接试剂盒(Rapid DNA Ligation Kit) 是碧云天研发的一种把DNA片段在短至5-10分钟内快速插入到载体(vector)中的连接试剂盒。对于双粘端DNA片段的插入仅需5-10分钟即可完成,对于双平端DNA片段的插入仅需15分钟即可完成。同时本试剂盒也可以用于其它各种常规的双链DNA连接反应。连接30分钟即可达到最佳效果,与连接过夜的效果一致。
本试剂盒可以用于PCR片段和载体的连接、酶切产物和载体的连接、linker和载体的连接、linker和linker的连接等各种双链DNA的连接。
为了获得快速高效的连接效果,本试剂盒采用了一种特殊的高活力Rapid T4 DNA Ligase以及相应的快速连接缓冲液,确保在短时间内可以获得很好的连接效果。连接30分钟和连接过夜的效果相当,通常只须连接5-10分钟即可满足常规用途(图1)。
图1.快速DNA连接试剂盒实测效果图。双酶切后的载体室温自连30min(A)或16℃自连过夜(D)作为阴性对照;双酶切后的载体与待插入片段室温连接10min(B)、30min(C)或者16oC连接过夜(E),随后转化细菌涂板,并于第二天取平板观察拍照。
在确保连接效果的同时,确保完成连接后不必进行任何纯化即可直接转化细菌。另外,快速连接缓冲液中已经含有ATP、镁离子等各种必需物质,无需再添加其它任何试剂。
本试剂盒用于总体积为10μl的连接体系时可以进行500个连接反应,用于总体积为20μl的连接体系时可进行250个连接反应。
包装清单:
产品编号 |
产品名称 |
包装 |
D7003-1 |
快速连接缓冲液(2X) |
0.5ml0.5ml/管, 共5管 |
D7003-2 |
Rapid T4 DNA ligase |
250μl |
— |
说明书 |
1份 |
保存条件:
-20℃保存。
注意事项:
连接反应完成后即可直接转化细菌,请勿采用加热方法失活Rapid T4 DNA ligase。加热处理会导致后续的转化效率显著下降。
对于载体单酶切插入外源片段的情况,需注意对载体进行脱磷处理,以避免质粒自连。
快速连接缓冲液(2X)使用前一定要完全溶解并混匀,加入到连接体系后也须注意混匀。
本产品仅限于专业人员的科学研究用,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品,不得存放于普通住宅内。
为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。
使用说明
使用说明:
1. PCR产物或酶切片段和普通载体的连接:
a. 取1-2μg载体酶切过夜,或至少酶切3-5小时以上。尽量确保酶切充分,否则后续会导致产生很多
自连的克隆。
b. 载体酶切完毕后,可以使用试剂盒进行纯化,例如碧云天的PCR纯化试剂盒/DNA纯化试剂盒
(D0033)。也可以采用常规的酚氯仿抽提乙醇沉淀方法纯化载体。对于酶切产生较大片段(大于50-
60bp)的情况推荐采用切胶回收的方式。
c. 对于PCR产物:PCR产物凝胶电泳后,切胶回收预期大小的DNA片段。凝胶中DNA片段的回收可以使
用试剂盒进行操作,例如碧云天的DNA凝胶回收试剂盒(D0056)。也可以采用反复冻融等方法回收
DNA片段。
d. 对于回收的PCR产物或其它需酶切的质粒或DNA片段,用适当内切酶酶切,随后纯化酶切产物。
注:这一步的酶切不必酶切特别充分,通常酶切效率能达到80-90%以上即可。即本步骤的酶切
通常酶切1-2小时即可。酶切产物可以使用试剂盒进行纯化,例如碧云天的PCR纯化试剂盒/DNA纯
化试剂盒(D0033)。也可以采用常规的酚氯仿抽提乙醇沉淀方法纯化载体。
e. 取约25-100ng经过酶切和纯化的载体,加入3倍摩尔数的待插入片段。参考下表设置连接反应体
系。
注:很多时候由于载体量和待插入片段的量都比较少,在回收后很难定量。此时可以根据回收前
电泳条带的亮度进行大致的估计。通常以DNA分子量标准的某一条带为参考,估计或通过灰度半定
量您的目的条带和该参考条带的亮度的比例关系。然后再按照预计的纯化或凝胶回收时的得率计
算出最终得到的载体量和待插入片段量的比例关系。
载体 |
约25-50ng |
约50-100ng |
待插入片段 |
约载体摩尔数的3倍 |
约载体摩尔数的3倍 |
快速连接缓冲液(2X) |
5μl |
10μl |
双蒸水或MilliQ水 |
至9.5μl |
至19μl |
Rapid T4 DNA ligase |
0.5μl |
1μl |
总体积 |
10μl |
20μl |
f. 用移液器轻轻吹打混匀或轻微Vortex混匀,室温离心数秒,使液体积聚于管底。
g. 室温(25℃)孵育连接5-10分钟或更长时间。对于双平端连接需室温(25℃)孵育15-30分钟或更长时
间。
注1:对于双粘端连接:室温孵育5-10分钟通常可以达到孵育更长时间所能达到最佳连接效率的 70%以上。室温孵育60分钟和16℃孵育过夜相比,无显著差异。连接5-10分钟后,如果转化等后续
步骤还没有准备好,完全可以适当延长连接时间。但通常不宜超过60分钟。如果可能超过60分
钟,可以在4℃或16℃放置较长时间甚至过夜。
注2:对于双平端连接:室温孵育15分钟通常可以达到孵育更长时间所能达到最佳连接效率的
70%以上。室温孵育60分钟和16℃孵育过夜相比,无显著差异。连接15分钟后,如果转化等后
续步骤还没有准备好,完全可以适当延长连接时间。但通常不宜超过60分钟。如果可能超过60分
钟,可以在4℃或16℃放置较长时间甚至过夜。
注3:上述室温连接效率的数据在25℃时获得,在20-27℃时获得的连接效率比较接近。室温较低
或较高时推荐在25℃水浴进行连接。
h. 随后即可直接取连接产物用于转化感受态细菌。
2. PCR产物和T载体的连接:
a. PCR产物凝胶电泳后,切胶回收预期大小的DNA片段。凝胶中DNA片段的回收可以使用试剂盒进行操
作,例如碧云天的DNA凝胶回收试剂盒(D0056)。也可以采用反复冻融等方法回收DNA片段。
b. 按照T载体的说明书取适量T载体,加入3倍摩尔数的待插入片段。参考下表设置连接反应体系。
注:很多时候由于载体量和PCR产物的量都比较少,在回收后很难定量。此时可以根据回收前电
泳条带的亮度进行大致的估计。通常以DNA分子量标准的某一条带为参考,估计或通过灰度半定量
您的目的条带和该参考条带的亮度的比例关系。然后再按照预计的纯化或凝胶回收时的得率计算
出最终得到的载体量和PCR产物的量的比例关系。
T载体 |
适量 |
适量 |
待插入片段 |
约载体摩尔数的3倍 |
约载体摩尔数的3倍 |
快速连接缓冲液(2X) |
5μl |
10μl |
双蒸水或MilliQ水 |
至9.5μl |
至19μl |
Rapid T4 DNA ligase |
0.5μl |
1μl |
总体积 |
10μl |
20μl |
c. 用移液器轻轻吹打混匀或轻微Vortex混匀,室温离心数秒,使液体积聚于管底。
d. 室温孵育5-10分钟或更长时间。
注:室温孵育5-10分钟通常可以达到孵育更长时间所能达到最佳连接效率的70%以上。室温孵育
30分钟和16℃孵育过夜相比,无显著差异。连接5-10分钟后,如果转化等后续步骤还没有准备
好,完全可以适当延长室温的连接时间。但通常不宜超过60分钟。如果可能超过60分钟,可以在
4℃或16℃放置较长时间甚至过夜。
e. 随后即可直接取连接产物用于转化感受态细菌。
3. Linker或RNAi片段和载体的连接:
a. 载体的酶切和纯化同步骤1a和1b。
b. Linker或RNAi片段的退火可以选择适当的DNA退火缓冲液,例如碧云天的Annealing Buffer for
DNA Oligos(5X)(D0251), 进行退火反应。
c. 长度大于8bp的Linker或退火的RNAi片段,可以按照5:1至10:1的比例和载体进行连接反应。例如
载体为0.03pmol,则插入片段可以为0.15至0.3pmol。长度小于8bp的linker,比例需调整为10:1
以上。
d. 除插入片段的用量外,随后按照步骤1e-1h进行。
4. DNA自身环化的连接:
参考步骤1e,待插入片段换成适量的水即可。其余步骤按照步骤1f,1g,和1h进行。
5. 其它类型的DNA片段连接参考上述方法进行。
常见问题:
1. 连接反应后转化效率很低或阳性克隆非常少:
a. 可能在加入快速连接缓冲液(2X)后没有充分混匀。
b. 可以尝试提高载体或插入片段的纯度。对于平端连接需注意适当延长连接时间。
c. 可能载体酶切不够充分,用未经连接的载体转化作为阴性对照。
d. 用存放DNA的溶液进行转化,作为阴性对照,检测感受态细菌是否存在问题。
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使用本产品的文献:
1. Shi Y, Huang H, Deng X, He X, Yang J, Yang H, Shi L, Mei L, Gao J, Zhou N.
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foradipokinetic hormones from silkworm Bombyx mori.
J Biol Chem. 2011 Dec 9;286(49):42390-402.
2. Yang J, Huang H, Yang H, He X, Jiang X, Shi Y, Alatangaole D, Shi L, Zhou N.
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corazonin
from the silkworm, Bombyx mori, dually couples to the G(q) and G(s) signaling
cascades.
J Biol Chem. 2013 Apr 26;288(17):11662-75. doi: 10.1074/jbc.M112.441675.
3. Deng X, Yang H, He X, Liao Y, Zheng C, Zhou Q, Zhu C, Zhang G, Gao J, Zhou N.
Activation of Bombyx neuropeptide G protein-coupled receptor A4 via a Gαi-dependent
signaling pathway by direct interaction with neuropeptide F from silkworm, Bombyx mori.
Insect Biochem Mol Biol. 2014 Feb;45:77-88. doi: 10.1016/j.ibmb.2013.12.007.
Epub 2013 Dec 27.
4. Chen X, Zheng C, Qian J, Sutton SW, Wang Z, Lv J, Liu C, Zhou N.
Involvement of β-arrestin-2 and clathrin in agonist-mediated internalization of the human cannabinoid CB2 receptor.
Curr Mol Pharmacol. 2014;7(1):67-80.
5. Yang W, X Dai, M Liu.
Development of an Indirect Competitive Enzyme-linked Immunosorbent Assays Method Based on Immunomagetic-bead for Analyzing Listeria monocytogenes in Food.
Am J Food Technol. 2016;11(3):100-107.
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