产品编号 | 产品名称 | 产品包装 | 产品价格 |
R0616S | RtcB Ligase | 25次 | 288.00元 |
R0616M | RtcB Ligase | 100次 | 868.00元 |
R0616L | RtcB Ligase | 500次 | 3288.00元 |
碧云天生产的RtcB Ligase,即RtcB连接酶,是一种可催化单链RNA分子3'末端的3'-磷酸或2', 3'-环磷酸与单链RNA分子5'末端的5'-羟基连接的酶。本产品和RtcB Ligase (High Concentration) (R0617)相比,仅酶浓度不同,其余特性相同。如果希望获得更高的连接效率,推荐尝试RtcB Ligase (High Concentration)。
RtcB Ligase主要用于单链RNA分子之间的连接或单链RNA的环化,连接时需要3'-磷酸或2', 3'-环磷酸基团和5'-羟基的存在。
RtcB Ligase也可以用于DNA (Donor)和DNA (Acceptor)、RNA (Donor)和DNA (Acceptor)之间的连接,但连接效率非常低。
RtcB Ligase主要用于3'-磷酸或2', 3'-环磷酸末端的单链RNA/DNA分子与5'-羟基末端的单链RNA分子的连接;对于单链RNA、单链DNA或单核苷酸分子间或分子内5'-P末端与3'-OH末端之间的连接,推荐使用碧云天生产的T4 RNA Ligase 1 (ssRNA Ligase) (R0621)或T4 RNA Ligase (D7021);对于双链RNA的连接,推荐使用碧云天生产的T4 RNA Ligase 2 (dsRNA Ligase) (R0632);对于5'端预腺苷酰化的DNA或RNA (App-DNA或App-RNA)与3'端羟基的RNA的连接,推荐使用碧云天生产的T4 RNA Ligase 2, truncated (R0635)或T4 RNA Ligase 2, truncated KQ (R0637)。
RtcB Ligase的催化连接反应需GTP、MnCl2的参与,并在反应过程中生成GMP,用于底物3'-磷酸末端的活化和连接;对于末端是2', 3'-环磷酸的底物,须先将末端水解为3'-磷酸基团,再由GMP进行活化连接[1, 2]。
碧云天RtcB Ligase催化连接ssRNA的效果请参考图1。
图1.碧云天RtcB Ligase (R0616)催化连接ssRNA的效果图。在20µl反应体系(50mM Tris-HCl,75mM KCl,3mM MgCl2,10mM DTT (pH 8.3 @ 25ºC) )中加入10pmol长度为20nt的ssRNA (5'-OH-UGGCUCCGAUAUCACGCUUCp-3'),适量BeyoPure™ Ultrapure Water (DNase/RNase-Free, Sterile) (ST876),以及最终浓度为图中所示的本产品或N公司(Competitor)的RtcB Ligase,37ºC孵育1小时进行反应。取反应后产物5μl,加入5μl DNA/RNA Loading Buffer (2X, for Denaturing PAGE) (R0212),进行15%变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(180V电泳60分钟),随后使用NA-Red (EB升级换代产品,2000X) (D0128/D0130)室温染色5分钟,在紫外灯下观察实验结果。如图所示,本产品与N公司的RtcB Ligase产品相比,具有类似的连接ssRNA的效果。Inter-ligated product为分之间连接的产物,Intra-ligated product为分子内连接形成的环形小RNA。实际检测效果会因实验条件、检测仪器等的不同而存在差异,图中数据仅供参考。
用途:用于末端为3'-磷酸或2', 3'-环磷酸的ssRNA或ssDNA分子与末端为5'-羟基的ssRNA的连接;ssRNA的环化;使用标记探针检测末端为3'-磷酸、2', 3'-环磷酸或5'-羟基的RNA。
来源:纯化自携带编码大肠杆菌RtcB Ligase基因的E.coli重组菌株。
纯度:不含DNA内切酶和外切酶,不含RNA酶,不含磷酸酯酶。
酶储存溶液:10mM Tris-HCl, 50mM NaCl, 1mM DTT, 0.1mM EDTA, 50% Glycerol (pH 7.4 @ 25ºC)。
10X Reaction Buffer:500mM Tris-HCl, 30mM MgCl2, 750mM KCl, 100mM DTT (pH 8.3 @ 25ºC)。
包装清单:产品编号 | 产品名称 | 包装 |
R0616S-1 | RtcB Ligase (15µM) | 25µl |
R0616S-2 | 10X Reaction Buffer | 60µl |
R0616S-3 | GTP (1mM) | 60µl |
R0616S-4 | MnCl2 (10mM) | 60µl |
— | 说明书 | 1份 |
产品编号 | 产品名称 | 包装 |
R0616M-1 | RtcB Ligase (15µM) | 100µl |
R0616M-2 | 10X Reaction Buffer | 250µl |
R0616M-3 | GTP (1mM) | 250µl |
R0616M-4 | MnCl2 (10mM) | 250µl |
— | 说明书 | 1份 |
产品编号 | 产品名称 | 包装 |
R0616L-1 | RtcB Ligase (15µM) | 500µl |
R0616L-2 | 10X Reaction Buffer | 1.2ml |
R0616L-3 | GTP (1mM) | 1.2ml |
R0616L-4 | MnCl2 (10mM) | 1.2ml |
— | 说明书 | 1份 |
-20ºC保存,至少一年有效。
注意事项:本产品提供的试剂均用不含DNA酶和RNA酶的水配制,可直接用于3'端为磷酸或2', 3'-环磷酸的ssRNA/ssDNA和5'端为羟基的ssRNA之间的连接反应。
本产品连接的底物需要确保5'末端是羟基,同时3'末端是磷酸或2', 3'-环磷酸。此外,反应体系中必须加入GTP、MnCl2。
如果连接底物为双链RNA或DNA,推荐使用碧云天生产的T4 RNA Ligase 2 (dsRNA Ligase) (R0632)等系列产品。
如果连接底物是5'末端磷酸化或腺苷酰化、3'末端是羟基的ssRNA或ssDNA,推荐使用碧云天生产的T4 RNA Ligase 1 (ssRNA Ligase) (R0621)等系列产品。
可根据具体应用选择合适的操作方法,可能需准备额外的试剂,如碧云天生产的RNase inhibitor (R0101/R0102/R0105/R0106)、DEPC水(DNase、RNase free) (R0021/R0022)、BeyoPure™ Ultrapure Water (DNase/RNase-Free, Sterile) (ST876)等。
使用本产品进行连接反应时,如果底物过多或过少,在反应体系中加入PEG8000至终浓度为15%很多情况下可以显著提高连接效率,同时不影响反应特性。推荐使用PEG8000 (50%, RNase free) (R0056)。
本产品使用时宜存放在冰盒内或冰浴上,使用完毕后宜立即放置于-20ºC保存。
本产品仅限于专业人员的科学研究用,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品,不得存放于普通住宅内。
为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。
Reagent | Volume | Final Concentration |
Ultrapure Water | (13-X-Y)µl | - |
10X Reaction Buffer | 2µl | 1X |
GTP (1mM) | 2µl | 0.1mM |
MnCl2 (10mM) | 2µl | 1mM |
3'-phosphate ssRNA | Xµl (10pmol) | 0.5µM |
5'-OH ssRNA | Yµl (10pmol) | 0.5µM |
RtcB Ligase (15µM) | 1µl | 0.75µM |
Total Volume | 20µl | - |
产品编号 | 产品名称 | 包装 |
D7021 | T4 RNA Ligase | 200U |
R0021/R0022 | DEPC水(DNase、RNase free) | 100ml/500ml |
R0051 | Annealing Buffer for RNA Oligos (5X) | 1ml |
R0056 | PEG8000 (50%, RNase free) | 2ml |
R0058 | MgCl2 (100mM, DEPC-treated) | 1ml |
R0102 | RNase Inhibitor | 2kU/10kU/50kU |
R0123 | RNase and DNase Away | 250ml |
R0125 | RNase, DNase and DNA Away | 250ml |
R0127 | RNase, DNase, RNA and DNA Away | 250ml |
R0616 | RtcB Ligase | 25次/100次/500次 |
R0617 | RtcB Ligase (High Concentration) | 25次/100次/500次 |
R0621 | T4 RNA Ligase 1 (ssRNA Ligase) | 1kU/5kU |
R0632S | T4 RNA Ligase 2 (dsRNA Ligase) | 1000U |
R0635 | T4 RNA Ligase 2, truncated | 5kU/20kU/100kU |
R0700S | 小RNA 3'接头(5'腺苷化, 3'封闭)及连接试剂盒 | 20次 |
R0702 | Universal miRNA Cloning Linker (5'腺苷化3'封闭) | 1µg/5µg |
R0716 | 5' DNA Adenylation Kit | 10次/50次 |
ST036 | DEPC | 10g |
ST483 | PEG8000 | 500g |
ST484 | 50% PEG8000 (DNase, RNase & Protease free, Sterile) | 10ml/100ml |
ST876 | BeyoPure™ Ultrapure Water (DNase/RNase-Free, Sterile) | 100ml/500ml |
ST1249 | DEPC (≥97%, Reagent grade) | 2ml/10ml |