RNA高通量测序必备:RNA/DNA去甲基化酶了解下
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N6 -Methyladenosine (m6 A)是真核生物中一种非常普遍和丰富的RNA转录后修饰,存在于多种真核或病毒RNA中。
在RNA高通量测序建库的过程中,RNA中被修饰的核苷酸会对反转录造成干扰,导致转录终止或转录错误,因此在反转录之前,利用特定的去甲基化酶对可能含有m6A、1-甲基腺嘌呤(m1A)、3-甲基胞嘧啶(m3 C)或1-甲基鸟嘌呤(m1G)的RNA进行去甲基化处理至关重要!

碧云天全新推出AlkB (RNA/DNA去甲基化酶, Nuclease-free),该产品是由碧云天自主研发的PerfectProtein™技术平台通过大肠杆菌表达、纯化获得的不含DNase和RNase的高品质重组酶,可以有效去除RNA甲基化修饰,适用于ARM-seq、PANDORA-seq等RNA的高通量测序,提高甲基化修饰RNA测序的灵敏度和特异性,揭示更多未被发现的小RNA,获得更准确的RNA测序结果!

产品原理:
AlkB是一种α-酮戊二酸(α-Ketoglutarate, α-KG)和Fe(II)依赖的双加氧酶(Dioxygenase),可以有效地修复单链或双链DNA和RNA中的各种烷基化损伤(Alkylation damage),常被用于去除RNA中的m6A等甲基化修饰,去除DNA中的m1A、m3C、m6A等修饰,并进一步用于后续的qPCR或高通量测序分析。

产品用途:
▶   RNA的m6A、m1A、m3C或m1G去甲基化;
▶   ARM-seq、PANDORA-seq等RNA高通量测序;
▶   DNA的m1A、m3C和m6A的去甲基化。

产品特点:
1. 纯度高:不含DNA内切酶和外切酶,不含RNA酶,不含磷酸酯酶。避免RNase对RNA的高通量测序等带来负面影响;
2. 去甲基化效果显著:实验结果显示,4µg的HEK 293T细胞总RNA用4U碧云天的AlkB蛋白37ºC孵育处理100min后,可以充分去除其中的m6A甲基化;
3. 性价比高:由碧云天自主研发的PerfectProtein™技术平台通过大肠杆菌表达、纯化获得,超高性价比。

产品效果:

图1. 碧云天生产的AlkB对HEK 293T细胞总RNA的m6A修饰的去甲基化效果图。如图所示,本产品对HEK 293T细胞总RNA的m6A去甲基化效果显著。实验结果显示,4µg的HEK 293T细胞总RNA用4U碧云天的AlkB蛋白37℃孵育处理100min后,可以充分去除其中的m6A甲基化。图中的检测效果仅供参考,不同的实验条件获得的检测效果可能会略有不同。

产品信息
产品编号 产品名称 产品包装 产品价格
R0639S AlkB (RNA/DNA去甲基化酶, Nuclease-free) 200U
R0639M AlkB (RNA/DNA去甲基化酶, Nuclease-free) 1000U
R0639L AlkB (RNA/DNA去甲基化酶, Nuclease-free) 5000U